Обрізка є однією із основних і дуже важливих технік формування бонсай. Часто, люди тільки почавши освоювати мистецтво вирощування бонсай не хочуть обрізати дерево, вважаючи що це жорстоко по відношенню до дерева. Але насправді це не так. Обрізка дерев стимулює їх зростання, а також продовжує довговічність дерева. Чому ж не обрізати дерево якщо цим займається природа? Саме так, тварини постійно обривають гілки, також багато гілок гинуть через нестачу води і світла.

    Більшість новачків роблять поширену помилку - саджають дерева із товщиною стовбура у пів сантиметра в плошку і вважають що це вже бонсай. При цьому вони навіть не підозрюють що їхні "бонсай" це всього лиш тоненькі
черешки і якщо їх посадити у маленький контейнер то зних ніколи не вийде справжнього бонсай. Вважається нормою коли товщина дерева дорівнює шості частині його висоти.

   Найкращим методом формування стовбура бонсай є його поступова обрізка. Цей метод передбачає що ви вже визначились зі стилем і формою свого майбутнього бонсай і намалювали, схематично, як він має виглядати. Ви просто вирощуєте дерево поки товщина стовбура в самому низу не 
досягне двох третин бажаної товщини. Досягнувши такої товщини стовбур можна обрізати на місці першого вигину, де на зовнішній стороні є тоненька гілка. Якщо такої гілки нема, залишається надіятися що у верхній частині зрізу прокинуться сплячі бруньки, які згодом перетворяться на гілки. Одна із цих гілок стане лідером - продовженням стовбура. Дозвольте цьому лідеру порости декілька років. Чим довше ростуть гілки, тим швидше збільшується товщина стовбура нище цих гілок. В цей період обрізування гілок не проводиться взагалі,а якщо й проводиться то лише задля того щоб виділити лідера серед багатьох гілок. Обрізку лідера потрібно проводити ще до появи листків, в той момент коли у коренях накопичений максимальний запас енергії, яка після обрізування буде направлена на появу і швидкий ріст нових
гілок.

І на останок. Місця зрізу діаметром більше половини сантиметра потрібно замащувати спеціальним садовим варом або хоча б пластеліном, виключенням може бути хіба що фікус який виробляє спеціальне молочко для захисту своїх пошкоджень.